Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx49Q4FZF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms