Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
6430531B16RikQ3V2J1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms