Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29609Q3UU56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29609Q3UU56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms