Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cracr2aQ3UP38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms