Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln5Q3UMW8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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