Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl2Q3UMU9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl2Q3UMU9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms