Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zyg11bQ3UFS0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zyg11bQ3UFS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zyg11bQ3UFS0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264 ms