Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LbrQ3U9G9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LbrQ3U9G9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LbrQ3U9G9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms