Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbxip1Q3TVI8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pbxip1Q3TVI8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbxip1Q3TVI8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms