Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Calr4Q3TQS0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calr4Q3TQS0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms