Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cwc27Q3TKY6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cwc27Q3TKY6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cwc27Q3TKY6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms