Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prr27Q3SYJ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms