Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Traf3ip1Q149C2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf3ip1Q149C2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf3ip1Q149C2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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