Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisal1Q0VBP7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms