Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms