Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf541Q0GGX2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms