Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcnt1Q09324 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcnt1Q09324 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcnt1Q09324 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms