Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700061G19RikQ08EE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms