Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnma1Q08460 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnma1Q08460 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms