Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb2Q08331 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms