Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox13Q04891 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox13Q04891 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms