Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcad1Q04692 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcad1Q04692 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarcad1Q04692 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms