Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb4Q02738 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms