Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2cQ01098 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2cQ01098 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms