Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb1Q00420 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb1Q00420 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms