Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Loxl1P97873 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Loxl1P97873 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms