Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdr2P97817 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2P97817 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms