Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig3P97386 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig3P97386 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig3P97386 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig3P97386 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig3P97386 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lig3P97386 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig3P97386 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig3P97386 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms