Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx3P81067 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx3P81067 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx3P81067 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx3P81067 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx3P81067 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx3P81067 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms