Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sycp3P70281 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp3P70281 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sycp3P70281 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms