Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl8P62918 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl8P62918 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms