Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd3P62320 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms