Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpd1P62315 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snrpd1P62315 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms