Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp46P62069 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp46P62069 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp46P62069 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp46P62069 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp46P62069 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp46P62069 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp46P62069 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp46P62069 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp46P62069 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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