Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga11P61622 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga11P61622 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga11P61622 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga11P61622 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms