Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2fP61219 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2fP61219 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2fP61219 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms