Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl8P59280 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms