Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NcstnP57716 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NcstnP57716 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NcstnP57716 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NcstnP57716 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms