Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sssca1P56873 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms