Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn18P56857 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cldn18P56857 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cldn18P56857 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn18P56857 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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