Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SmoP56726 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SmoP56726 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SmoP56726 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SmoP56726 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SmoP56726 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmoP56726 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmoP56726 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmoP56726 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmoP56726 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmoP56726 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SmoP56726 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SmoP56726 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SmoP56726 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SmoP56726 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SmoP56726 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SmoP56726 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SmoP56726 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SmoP56726 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SmoP56726 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SmoP56726 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SmoP56726 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SmoP56726 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SmoP56726 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SmoP56726 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SmoP56726 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SmoP56726 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SmoP56726 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SmoP56726 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SmoP56726 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SmoP56726 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SmoP56726 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SmoP56726 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SmoP56726 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SmoP56726 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SmoP56726 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SmoP56726 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SmoP56726 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SmoP56726 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SmoP56726 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SmoP56726 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SmoP56726 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SmoP56726 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SmoP56726 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SmoP56726 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmoP56726 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmoP56726 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmoP56726 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SmoP56726 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmoP56726 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SmoP56726 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmoP56726 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmoP56726 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SmoP56726 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmoP56726 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmoP56726 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SmoP56726 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SmoP56726 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SmoP56726 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SmoP56726 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SmoP56726 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SmoP56726 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SmoP56726 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SmoP56726 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SmoP56726 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SmoP56726 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SmoP56726 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SmoP56726 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SmoP56726 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SmoP56726 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SmoP56726 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SmoP56726 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SmoP56726 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SmoP56726 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SmoP56726 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms