Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gp1bbP56400 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gp1bbP56400 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gp1bbP56400 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms