Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rpl9P51410 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl9P51410 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms