Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa9P50707 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa9P50707 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa9P50707 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms