Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcaP48428 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcaP48428 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcaP48428 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TbcaP48428 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TbcaP48428 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcaP48428 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcaP48428 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcaP48428 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcaP48428 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcaP48428 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcaP48428 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcaP48428 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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