Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CratP47934 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CratP47934 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CratP47934 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CratP47934 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CratP47934 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CratP47934 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CratP47934 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CratP47934 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CratP47934 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CratP47934 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CratP47934 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CratP47934 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CratP47934 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CratP47934 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CratP47934 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CratP47934 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CratP47934 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CratP47934 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CratP47934 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CratP47934 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CratP47934 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CratP47934 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CratP47934 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CratP47934 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CratP47934 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CratP47934 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CratP47934 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CratP47934 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CratP47934 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CratP47934 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CratP47934 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CratP47934 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CratP47934 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CratP47934 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CratP47934 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CratP47934 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CratP47934 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CratP47934 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CratP47934 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CratP47934 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CratP47934 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CratP47934 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CratP47934 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CratP47934 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CratP47934 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CratP47934 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CratP47934 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CratP47934 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CratP47934 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CratP47934 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CratP47934 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CratP47934 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CratP47934 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CratP47934 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CratP47934 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CratP47934 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms