Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11bP46638 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms