Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sipa1P46062 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sipa1P46062 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sipa1P46062 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sipa1P46062 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sipa1P46062 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sipa1P46062 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sipa1P46062 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms