Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdc2P43407 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms