Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgavP43406 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgavP43406 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgavP43406 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgavP43406 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgavP43406 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ItgavP43406 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ItgavP43406 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ItgavP43406 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
ItgavP43406 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ItgavP43406 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgavP43406 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgavP43406 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgavP43406 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgavP43406 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgavP43406 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgavP43406 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ItgavP43406 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms